O estado do Rio de Janeiro, apesar de ser um dos menores da federação, conta com alta biodiversidade em função da variedade de biótopos presentes dentro de suas fronteiras.  São serras com matas úmidas de encosta, campos de altitude e matas de neblina, matas de baixada, enclaves de mata seca, restingas, sistemas lagunares, um extenso litoral, um grande rio, o Paraíba do sul, campos naturais com áreas secas e alagadas e manguezais.  Muitos destes ambientes foram contemplados com uma legislação de conservação ambiental e estão razoavelmente preservados.  Outros estão em vias de desaparecer.  Mas mesmo com este quadro não muito otimista o estado não conta com uma lista extensa de espécies de aves comprovadamente extintas, (vide lista das aves do RJ).

Listamos todas as unidades de conservação do estado, citando quando possível sua localização e forma de acesso.  Lembramos que somente os Parques Nacionais e Estaduais são abertos a visitação pública.  As demais unidades de conservação podem ser visitadas por pesquisadores vinculados a projetos ou instituições de pesquisa mediante autorização do poder público.